j'ai trouvé ici : http://gentoo-wiki.com/Twinview_Example#Twinview_device_order
comment spécifier cela dans le fichier de configuration xorg.conf
et cela donne ça :
Option "TwinViewXineramaInfoOrder" "DFP-0"
Par contre gnome a toujours du mal avec le desktop et il y a toujours une "zone morte" inaccessible où il range malgré tout des icones :-/